Meyve bahçeleri ve bağlarda sorun olan böcek ve akar gibi zararlıları inceleyerek ve bunlara karşı en uygun mücadele yöntemlerini ortaya koymak amacıyla araştırma projeleri yürütmekle görevlidir.
Bununla birlikte;

Meyve bahçeleri ve bağlarda görülen zararlı organizmaların teşhisi, yayılışları, yoğunlukları ve ekonomik zarar düzeylerini tespit etmek,

Surveyler ile karantina organizmaları ve yeni ortaya çıkan zararlıların risklerini takip etmek, 

Meyve ve bağ alanlarında Ülkemizde yeni görülen ve karantinaya tabi zararlılara karşı uygun mücadele metotlarına yönelik çalışmalar yapmak,

Tahmin ve uyarı metotlarını çalışmak ve mücadele çalışmalarına entegre etmek,

Değişen çevre ve iklim koşullarında zararlı populasyonlarının dinamikleri üzerine araştırmalar yapmak,

Biyoteknik mücadele yöntemleri konusunda araştırma ve uygulamalar yapmak,

Bitki ve bitkisel ürünlerde ithalat, ihracat, bitki pasaportu ve sertifikasyon amaçlı analizleri yapmak, 

Vektör böceklerin belirlenmesi ve izlenmesine yönelik araştırmalar yapmak,

Bitki koruma ürünlerini ruhsatlandırma komisyonuna katılmak ve meyve ve bağ alanlarına ilişkin bitki koruma ürünlerinin etkinlik denemelerinin dosyalarını değerlendirmek,

            Başta karantina etmenlerine yönelik olmak üzere DNA Barkodlama ve genetik karakterizasyonu üzerine araştırmalar yapmak,

Elma Entegre Mücadele ülke koordinatörlüğünü yürütmek

Birimin görevleri arasındadır.