Birim'in başlıca görevleri, hububatta zarar oluşturan fungal hastalıkları morfolojik, biyolojik ve moleküler metotlar kullanarak teşhis etmek, yaygınlık ve zarar seviyelerini belirlemek, biyolojileri, epidemiyolojileri ve mücadele metotlarını ortaya koymaktır. 

Birim'de TÜBİTAK, Özel Sektör ve TAGEM tarafından desteklenen projeler yürütülmektedir.

Bunlar;

• Çeltik bitkisinin ana hastalığı olan Pyricularia oryzae (Çeltik Yanıklık Hastalığı)'nın ırkları, genetik varyasyonu ve bazı çeltik çeşitlerinin hastalığa karşı reaksiyon çalışması,
• Yulaf ekim alanlarında görülen pas hastalıklarının (Puccinia spp.) tespiti, bazı yulaf genotiplerinin Puccinia graminis f. sp. avenae (Kara pas) etmeninin ırklarına karşı dayanıklılıklarının belirlenmesi çalışmaları,
• Buğdayda Başak Yanıklığı (Fusarium culmorum, F. graminearum) hastalığının sonucunda oluşan toksin miktarının kimyasal mücadele ile azaltma olanaklarının araştırılması,
• Acibenzolar S-methyl (ASM) 'in mısırda sap ve koçan çürüklüğü hastalığına (Fusarium verticilloides) karşı biyolojik etkinliğinin araştırılması ve mücadelesine esas olarak standart ilaç deneme metoduna yönelik çalışmalar,
• Ülkesel Buğdayda Kök Çürüklüğü Hastalıkları Projesinin koordinasyonu,
• Marmara Bölgesi mısır ıslah araştırmalarında geliştirilen genotiplerin sap ve koçan
  çürüklüğü hastalığına neden olan Fusarium moniliforme'ye karşı reaksiyonlarının belirlenmesi,
• Mısırda Aspergillus parasiticus'a karşı Afla Guard (Aspergillus flavus NRRL 21882)'ın biyolojik etkinliğinin araştırılması ve mücadelesine esas olarak standart ilaç deneme metoduna yönelik çalışmalar,
• Hububatta Sürme hastalığına sebep olan Tilletia spp.'nin teşhisi ve yaygınlığının belirlenmesi projesi çalışılmaktadır.

 Birim'de çalışılmış bazı projeler:

• Gaeumannomyces graminis, Zymoseptoria tritici, Rhynchosporium secalis, Rhizoctonia ve Fusarium türlerinin sebep olduğu hastalıkların mücadele metotları ve Türkiye'de çim alanlarında görülen hastalıkların tespiti, yaygınlıkları ve mücadele metotlarının belirlenmesi,
• Zymoseptoria tritici'nin bazı popülasyonlarında azole ve strobilurin grubu fungisitlere karşı direnç oluşumunun tespit edilmesi,
• Kuzey (Exserohilum turcicum (Pass)) ve Güney (Bipolaris maydis (Nisk.&M'yale) Mısır Yaprak Yanıklığı hastalıklarının patojenik morfolojik karakterizasyonu ve moleküler tanımlanması ile ilgili çalışmalar,

 Bunun yanı sıra, iç ve dış karantinaya tabi hastalıklar ile Tarım İl/İlçe Müdürlüklerinden gelen numunelerin analizi yapılmaktadır.