Müdürlüğümüz Viroloji Laboratuvarında; ülke ekonomisi açısından önem taşıyan meyve, bağ ve süs bitkilerinde görülen virüs hastalıklarının serolojik (ELISA), moleküler ve biyolojik yöntemlerle tespiti yapılmaktadır.
Mikoloji laboratuarında; meyvelerde görülen bitki fungal hastalıklarının teşhisi ve kültür ortamlarındamuhafazası yapılmaktadır. Bunun yanında fungal hastalık etmenleri ile ilgili çeşit dayanıklılık/hassasiyet çalışmaları yürütülmektedir.
Moleküler Biyoloji labaratuarında; mevcut gen kaynaklarındaki populasyonların tanımlanması, genotipler arasındaki genetik ilişkilerin ortaya konulması, DNA parmak izlerinin çıkarılması, çeşit tanımlama, genetik haritalama, moleküler işaretleyici yardımıyla seleksiyon, bazı biyotik ve abiyotik koşullara dayanım mekanizmasını tespit etme çalışmaları yapılmaktadır.
Entomoloji laboratuarında; klimatize edilmiş böcek yetiştirme odalarında Elma içkurdu (Cydia pomonella) suni besin ortamında çoğaltılmaktadır. Yürütülen Tübitak projesi çerçevesinde Isparta ili ve ilçelerinden toplanan populasyonlarda; bölgede yoğun olarak kullanılan farklı insektisitlerin elma içkurdunda dayanıklılık oluşturup oluşturmadığını belirlemek amacıyla bioassay ve biokimyasal çalışmalar yapılmaktadır. Buna ek olarak farklı insektisitlerin etkinlik denemeleri, zararlıların mücadelesinde kullanılan biyoteknik yöntemlerle ilgili çalışmalar, ile biyoteknik yöntemlerle insektisitlerin kombine uygulanmasına yönelik çalışmalar yürütülmektedir.