Sebze ve yem bitkileri zararlıları konusunda, Ege Bölgesinde yemeklik baklagillerde, lahanada, enginar, hıyar, domates, patlıcan, patates, kabak ve hıyar gibi sebzelerde ülkesel ve bölgesel araştırmalar yürütülmüş bu sebzelerde sorun olan ekonomik öneme sahip olan zararlılar saptanarak bunlara karşı mücadele yöntemleri geliştirilerek ürün kaybı önlenmiştir.
Örtüaltı sebze yetiştiriciliğinde yürütülen entegre mücadele projesinde, Ege Bölgesi örtüaltı yetiştiriciliğinde zararlılara karşı çok az veya hiç ilaç kullanılmadan ürün elde edilmiştir. Bu proje çerçevesinde geliştirilen biyoteknik yöntemler içinde değerlendirilen kitlesel yakalamada oldukça etkin olan sarı yapışkan tuzaklar, Ege bölgesinde yaygın bir şekilde kullanılmaya başlanmıştır. FAO tarafından desteklenen bir araştırmada da örtüaltı domates yetiştiriciliğinde kimyasal girdiyi en aza indirmek için entegre mücadele araştırma sonuçlarının uygulamaya aktarılması, üreticilere uygulamalı olarak öğretilmesi ve yayımının yapılması amacıyla Muğla-Fethiye İlçesinde 2002-2003 yıllarında örtüaltı domates yetiştiriciliğinde çalışmalar yürütülmüştür. Muğla'da örtüaltı domates yetiştiriciliğinde, 2002-2004 yıllarında, entegre ürün yönetim programının oluşturulması amacıyla ele alınan bir diğer projede de üniversite ve özel sektör işbirliği yapılmış bir çok alt disiplin bir arada çalışmış, araştırmalar sonucunda örtü altı domates yetiştiriciliğinde Entegre Ürün Yönetimi programı belirlenmiştir.
TÜBİTAK tarafından desteklenen Ülkesel Patates Tohumluk Üretim Sisteminin Geliştirilmesine yönelik bir araştırma projesi kapsamında 2005-2009 yıllarında Kütahya, Burdur ve Isparta'da zararlılar yönüyle çalışmalar yapılarak patates tohumluk üretim alanının belirlenmesine katkı sağlanmıştır.
Enstitümüz Sebze ve Yem Bitkileri Zararlıları Laboratuvarı koordinatörlüğünde yürütülen "Ülkesel Tuta absoluta (Lepidoptera:Gelechiidae) projesi" kapsamında 2011-2014 yıllarında çalışılan alt projelerle zararlının yayılışı, doğal düşmanları, biyoteknik mücadele yöntemleri belirlenmiştir.. Biyoteknik yöntemler kapsamında Ege Bölgesinde İzmir ve Manisa illerinde tarla domates yetiştiriciliğinde feromon+su tuzakları, Muğla'da örtüaltı domates yetiştiricliğinde feromon+su ve feromon+ışık+su tuzaklarının T.absoluta'ya karşı Kitle Halinde Tuzakla Yakalama kapsamında etkinlikleri belirlenerek, sonuçlar üreticilerin kullanımına sunulmuştur.
Endüstri ve süs bitkileri zararlıları laboratuvarı tarafından Ege Bölgesi'nde pamuk, tütün, ayçiçeği, haşhaş ve susam gibi endüstri bitkileri ile nergis, gül, karanfil ve kasımpatı gibi süs bitkilerinde araştırmalar yürütülmüş, sorun olan ve ekonomik öneme sahip zararlıların biyolojisi, doğal düşmanları, yayılışı, zararı ve mücadelesi konularında çalışılarak elde edilen bulgular uygulamaya aktarılmıştır.
Pamukta ekonomik öneme sahip zararlılardan Pamuk yaprakbiti Aphis gossypii (Glov.) (Hemiptera: Aphididae)'nin biyolojisi ve popülasyon değişimini etkileyen faktörler çalışılarak, elde edilen veriler zararlının mücadelesinde uygulamaya aktarılmıştır.
Pamukta entegre mücadele projeleri yapılmış, bu çalışmalardan elde edilen bulgular Ege Bölgesi üreticilerine yapılan eğitimlerle aktarılmış, Entegre Mücadele Teknik Talimatı kitapları hazırlanarak ülke tarımına sunulmuştur.
Tütün zararlıları ile ilgili üretici kitapçığı hazırlanarak Ege Bölgesi üreticilerinin yararlanması sağlanmıştır. Tıbbi ve aromatik bitkilerden kekik bitkisinin Denizli ve Manisa İllerindeki ana zararlısı ve ekonomik öneme sahip diğer zararlı türleri tespit edilmiştir.
Karaburun İlçesi için önemli bir gelir kaynağı olan nergisin önemli sorunlarından nergis soğan sineklerine karşı üreticiler arasında yaygınlık bulmayan sıcak su uygulamasının etkili bir mücadele yöntemi olduğu, demonstrasyon çalışmalarıyla gösterilmiştir.
Ege Bölgesi'nde yaygın ekim alanı olan farklı pamuk çeşitlerinde emici böceklerin popülasyon değişimi ile verim ve kaliteye etkileri ile ilgili proje çalışması tamamlanmıştır. Emici böceklere karşı pamuk çeşit tercihinin tüylülük özelliklerine göre yapılarak Entegre mücadele programlarında kullanılabilmesi için emici böceklere karşı çeşitlerin tüylülük özelliklerine göre tercih edilmesi ortaya konmuştur.
Ayrıca laboratuvarda, dünyada yapılan güncel araştırmalara paralel olarak pamuk ve kesme çiçeklerde kaioromon ve yapışkan tuzakların birlikte kullanımı ile thrips türlerine karşı biyoteknik mücadele çalışmaları devam etmektedir.