Müdürlüğümüz Limnoloji Laboratuvarı’nda göl, gölet, baraj gölü, dere, çay, ırmak, nehir vb. gibi genel anlamda, iç sular rezervuarlarının fiziksel, kimyasal ve biyolojik özelliklerine ilişkin analizler ve ölçümler yapılmaktadır. Bu laboratuvarda yapılan çalışmalar şunlardır.
a) Planktonla ilgili çalışmalar,
b) Makrobentoza ait çalışmalar,
c) Balık biyolojisi, taksonomisi çalışmaları