​Lif Bitkileri Biriminin görevi Enstitümüzün sorumlu olduğu bölge pamuk alanlarında pamuk veriminin ve lif kalitesinin artırılması yönünde projeli araştırmalar yürütmekle görevlidir. Genel amaç çerçevesinde yürütülecek çalışmalarda birinci öncelikli amaç, verimli, üstün lif kalitesine sahip,  adaptasyon yeteneği yüksek, erkenci, makineli hasada uygun, hastalık zararlı ve çevre stres şartlarına dayanıklı yeni pamuk çeşitleri geliştirmek ve geliştirilen çeşitlerin üreticiye aktarılması amacıyla tohumluk programları düzenlemek ve yürütmektir. İkinci öncelikli amaç ise, bölge pamuk üreticilerinin üretim aşamasında karşılaştıkları yetiştirme tekniği sorunlarına (sırta ekim, gübreleme, sulama, bitki yönetimi, hasat yardımcıları ve makineli hasat) çözüm üretme yönünde projeler geliştirmektir.