Bitki Sağlığı Bölümü bünyesinde Mikoloji, Bakteriyoloji, Viroloji ve Entomoloji laboratuvarları bulunmaktadır. Laboratuvarlarda bitki sağlığı ile ilgili araştırma projeleri yürütülmekte olup ayrıca bölge illerindeki üreticilerden gelen bitki örneklerinin hastalık ve zararlı tanıları, teşhisleri, patates, çeltik ve buğday gibi ürünlerde ise ithalat ve ihracata tabi karantina analizleri yapılmaktadır.