Kurumumuz 22 Aralık 1994 tarih ve 94/22149 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile Ordu Arıcılık Üretme İstasyonu Müdürlüğü olarak kurulmuş olup, 30 Mayıs 1995 tarihli Bakanlık Makam Onayı ile Arıcılık Araştırma Enstitüsü Müdürlüğüne, 03 Haziran 2011 tarih ve 639 sayılı Kanun Hükmünde Kararname ile Arıcılık Araştırma İstasyonu Müdürlüğü’ne dönüştürülmüştür.

Yerleşke alanı olarak Ordu Merkeze 12 km mesafede, Ordu-Sivas karayolu üzerindeki Dedeli Mahallesi sınırları içerisinde 87 dekarlık bir alan seçilerek 1998 yılında Kurum hizmet binalarının inşaatına başlanmıştır. 2005 yılına kadar hizmetlerini Ordu İl Tarım Müdürlüğü hizmet binalarında sürdüren Kurumumuz 10 Ocak 2005 tarihinden itibaren inşaat çalışmaları biten Dedeli Yerleşkesinde hizmet vermeye başlamıştır.

23.06.2015 tarihli Resmi Gazete'de yayınlanarak yürürlüğe giren 7706 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ve 03 Haziran 2011 tarih ve 639 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile Bakanlığımızın yeniden yapılandırılmasına bağlı olarak  Kurumumuz Arıcılık Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü olarak yapılandırılmıştır ve günümüzde faaliyetlerine Tarım ve Orman Bakanlığı Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü'ne bağlı olarak devam etmektedir.

10.07.2018 tarihli ve 30474 sayılı Resmi Gazete'de yayınlanarak yürürlüğe giren Cumhurbaşkanlığı Teşkilatı Hakkında Cumhurbaşkanlığı Kararnamesi ile Kurumumuz Arıcılık Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü olarak Tarım ve Orman Bakanlığı Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü'ne bağlı olarak faaliyetlerine devam etmektedir.