​1. Araştırma ve Geliştirme

Enstitünün çalışma konularına giren bitki türlerinde bitki sağlığına yönelik; viroloji, bakteriyoloji, herboloji, mikoloji, entomoloji, nematoloji ve moleküler biyoloji ile biyolojik mücadele, entegre ürün yönetimi, tohum patolojisi-teknolojisi alanlarında araştırma çalışmaları yapmak, Bakanlık tarafından Enstitüye verilen görevler doğrultusunda; Zirai Mücadele Teknik Talimatı, Entegre Mücadele Teknik Talimatı, Standart İlaç Deneme Metotları, Faydalılara Pestisitlerin Yan Etki Deneme Metotları, Zararlı Risk Analizi değerlendirmeleri vb. konularda görüş sunmak, talimat hazırlamak,

2. Deneme ve Kontrol hizmetleri

Bakanlık talimatları çerçevesinde bölümün çalışma konularında kamu ve özel sektörle işbirliği halinde denemeler yürütmek, denetlemek ve virüsten ari sertifikalı fidan üretiminde fidanlıkların virüs hastalıkları yönünden kontrolünü ve gerekli analizleri yapmak,

3. Üretim Faaliyetleri

Biyolojik mücadele amacıyla faydalı böcek üretimleri yapmak, dağıtmak ve kolonizasyon çalışmalarını yapmak, önemli bitki hastalıklarının izolatlarını temin etmek ve çeşitli hastalık testlemeleri için izolat üretmek,

4. Laboratuvar Hizmetleri

Bitki koruma, zirai karantina, moleküler biyoloji, herboloji ve tohum patolojisi-teknolojisi hormon vb. alanlarında kamu ve özel sektöre laboratuvar hizmetleri vermek,

5. Danışmanlık Hizmetleri

Bölümün çalışma konularında kamu ve özel sektöre teknik danışmanlık hizmeti vermek,

6. Uygulamalı Eğitim, Yayın ve Yayım faaliyetleri

Bölümün çalışma konularında, kongre, konferans, çalıştay vb. bilimsel organizasyonlar, demonstrasyon, tanıtım günü vb. çiftçi eğitimine yönelik toplantılar ve hizmet içi eğitim faaliyetleri düzenlemek, düzenlenen organizasyonlara katılmak ve teknik destek sağlamak, araştırma projeleri kapsamında elde edilen çıktıları bilimsel yayın organlarında yayınlamak.​