Diyarbakır Zirai Mücadele Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü, 1954 yılında Ziraat İşleri Umum Müdürlüğü'ne bağlı olarak, Elazığ Zirai Mücadele Araştırma Enstitüsü olarak kurulmuştur.

1955 yılında Elazığ Zirai Mücadele Araştırma Enstitüsü’ne bağlı Diyarbakır Geçici Süne Araştırma istasyonu kurulmuştur.

15.05.1957 tarihinde kabul edilen 6968 sayılı Zirai Mücadele ve Zirai Karantina Kanununa göre teşkilat yapısı yeniden düzenlenerek Elazığ Bölge Zirai Mücadele Araştırma Enstitüsü olarak faaliyetlerine devam etmiştir. 1958 yılında Enstitü Elazığ'dan Diyarbakır ili merkezine taşınmıştır.

Müdürlüğümüz halen Diyarbakır-Silvan Karayolu 7'inci km de görevini yürütmektedir.​