​Bitki Hastalıkları Bölümü Mikoloji Laboratuvarında, bitkilerde hastalığa neden olan fungusların tanılanması, izolasyonu ve karakterizasyonuna yönelik çalışmalar yürütülmektedir. Laboratuvar​da hastalıklı bitki örneklerinden patojen fungusların saf kültüre alınması, PDA ve benzeri besi ortamlarında geliştirilmesi, makroskobik ve mikroskobik özelliklerinin incelenmesi temel faaliyetler arasındadır. Ayrıca spor morfolojisi, koloni yapısı ve gelişme özelliklerine göre teşhis çalışmaları yapılmakta, gerekli durumlarda patojenite testleri ile etmenin hastalık oluşturma yeteneği doğrulanmaktadır. Bölüm, tarımsal üretimde önemli ekonomik kayıplara yol açan fungal hastalıkların yayılışını izlemek, dayanıklı çeşit ve uygun mücadele yöntemlerinin belirlenmesine bilimsel veri sağlamak amacıyla arazi çalışmalarıyla laboratuvar sonuçlarını birlikte değerlendirmektedir.